Estava customizando o html dos comentários do drupal e senti uma certa dificuldade para executar esta tarefa. Assim, após pesquisa na internet, achei o módulo Comment Bonus API que provê algumas funcionalidades que o módulo de comentário não provê, como customizar o box que ficará os comentários e até colocar o formulário de comentário antes da listagem, caso seja necessário.
Para customizar o html, basta ativar o módulo e copiar o arquivo comment-wrapper.tpl.php para o tema usado. Agora é só alterar o html conforme desejado.